Introdução

A pandemia do novo coronavirus tomou o mundo de assalto. Notícias em todo o lugar dão conta do rápido alastramento do vírus em todo o mundo, e os seus números são alarmantes.

Para permitir que mais e mais pessoas possam ajudar no combate ao vírus, das mais diversas formas, organizações ao redor do mundo tem disponibilizado dados sobre a evolução da COVID-19 em todo o globo.

Dentre as organizações que disponibilizam dados estão a European Union Open Data Portal, a John Hopkins University através de um repositório no GitHub.

Com abundância de dados, me propus a realizar algumas explorações e tabulações destes dados visando entender melhor o cenário mundial.

Disclaimer

Este é um trabalho em andamento; não tem cunho científico e nem pretende que sirva de embasamento para qualquer tomada de decisão. É uma abordagem estritamente pessoal.

HOME HOME

Base de dados do EU Open Data Portal

Os dados desta seção vieram do Europe Open Data Portal – https://data.europa.eu/euodp/en/

2020-03-26: Houve uma mudança na nomenclatura dos arquivos; a partir da atualização de 25 de Março de 2020 o arquivo não mais tem o sufixo no formato da data, por exemplo, “…2020-03-24.xlsx”. Assim, algumas partes do código estão sendo mudadas para refletir esta mudança. Não sei se é uma mudança permanente ou alguém esqueceu de colocar o nome correto do arquivo.

A estrutura dos dados é:

## Classes 'tbl_df', 'tbl' and 'data.frame':    7710 obs. of  10 variables:
##  $ dateRep                : POSIXct, format: "2020-03-30" "2020-03-29" ...
##  $ day                    : num  30 29 28 27 26 25 24 23 22 21 ...
##  $ month                  : num  3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 ...
##  $ year                   : num  2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 ...
##  $ cases                  : num  8 15 16 0 33 2 6 10 0 2 ...
##  $ deaths                 : num  1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 ...
##  $ countriesAndTerritories: chr  "Afghanistan" "Afghanistan" "Afghanistan" "Afghanistan" ...
##  $ geoId                  : chr  "AF" "AF" "AF" "AF" ...
##  $ countryterritoryCode   : chr  "AFG" "AFG" "AFG" "AFG" ...
##  $ popData2018            : num  37172386 37172386 37172386 37172386 37172386 ...

Total de Casos pelos dados da EU Open Data Portal: 29-03-2020

Casos no Mundo (EU Open Data Portal)
715660

Brasil vs Itália

Uma mostra dos últimos 20 dias da Itália.

DateRep Day Month year Cases Deaths Country geoId countryterritoryCode popData2018 CumCases
2020-03-11 11 3 2020 977 167 Italy IT ITA 60431283 10149
2020-03-12 12 3 2020 2313 196 Italy IT ITA 60431283 12462
2020-03-13 13 3 2020 2651 189 Italy IT ITA 60431283 15113
2020-03-14 14 3 2020 2547 252 Italy IT ITA 60431283 17660
2020-03-15 15 3 2020 90 173 Italy IT ITA 60431283 17750
2020-03-16 16 3 2020 6230 370 Italy IT ITA 60431283 23980
2020-03-17 17 3 2020 4000 347 Italy IT ITA 60431283 27980
2020-03-18 18 3 2020 3526 347 Italy IT ITA 60431283 31506
2020-03-19 19 3 2020 4207 473 Italy IT ITA 60431283 35713
2020-03-20 20 3 2020 5322 429 Italy IT ITA 60431283 41035
2020-03-21 21 3 2020 5986 625 Italy IT ITA 60431283 47021
2020-03-22 22 3 2020 6557 795 Italy IT ITA 60431283 53578
2020-03-23 23 3 2020 5560 649 Italy IT ITA 60431283 59138
2020-03-24 24 3 2020 4789 601 Italy IT ITA 60431283 63927
2020-03-25 25 3 2020 5249 743 Italy IT ITA 60431283 69176
2020-03-26 26 3 2020 5210 685 Italy IT ITA 60431283 74386
2020-03-27 27 3 2020 6153 660 Italy IT ITA 60431283 80539
2020-03-28 28 3 2020 5959 971 Italy IT ITA 60431283 86498
2020-03-29 29 3 2020 5974 887 Italy IT ITA 60431283 92472
2020-03-30 30 3 2020 5217 758 Italy IT ITA 60431283 97689

O mesmo para o Brasil, últimos 20 dias.

DateRep Day Month year Cases Deaths Country geoId countryterritoryCode popData2018 CumCases
2020-03-11 11 3 2020 9 0 Brazil BR BRA 209469333 34
2020-03-12 12 3 2020 18 0 Brazil BR BRA 209469333 52
2020-03-13 13 3 2020 25 0 Brazil BR BRA 209469333 77
2020-03-14 14 3 2020 21 0 Brazil BR BRA 209469333 98
2020-03-15 15 3 2020 23 0 Brazil BR BRA 209469333 121
2020-03-16 16 3 2020 79 0 Brazil BR BRA 209469333 200
2020-03-17 17 3 2020 34 0 Brazil BR BRA 209469333 234
2020-03-18 18 3 2020 57 1 Brazil BR BRA 209469333 291
2020-03-19 19 3 2020 137 3 Brazil BR BRA 209469333 428
2020-03-20 20 3 2020 193 2 Brazil BR BRA 209469333 621
2020-03-21 21 3 2020 283 5 Brazil BR BRA 209469333 904
2020-03-22 22 3 2020 224 7 Brazil BR BRA 209469333 1128
2020-03-23 23 3 2020 418 7 Brazil BR BRA 209469333 1546
2020-03-24 24 3 2020 345 9 Brazil BR BRA 209469333 1891
2020-03-25 25 3 2020 310 12 Brazil BR BRA 209469333 2201
2020-03-26 26 3 2020 232 11 Brazil BR BRA 209469333 2433
2020-03-27 27 3 2020 482 20 Brazil BR BRA 209469333 2915
2020-03-28 28 3 2020 502 15 Brazil BR BRA 209469333 3417
2020-03-29 29 3 2020 487 22 Brazil BR BRA 209469333 3904
2020-03-30 30 3 2020 352 22 Brazil BR BRA 209469333 4256

As bases de dados não contém informação do Continente, ou seja, a qual continente pertence cada país. Assim, foi feito um merge com uma base que contém os nomes dos países, continente e a capital de cada país.

Os nomes dos países foram normalizados entre as bases, acertando grafia e outras inconsistências nos nomes. Países cujo continente não pode ser identificado foi marcado.

Alguns gráficos exploratórios com a base EU Open Data Portal

Países com mais de 500 casos confirmados: 29-03-2020

Países (com mais de 500 casos) ordenados por número de casos confirmados
País Casos Mortes
USA 143055 2509
Italy 97689 10781
China 82463 3311
Spain 78797 6528
Germany 57298 455
France 40174 2606
Iran 38309 2640
United Kingdom 19522 1228
Switzerland 14274 257
Netherlands 10866 771
Belgium 10836 431
South Korea 9661 158
Turkey 9217 131
Austria 8813 86
Canada 6255 61
Portugal 5962 119
Brazil 4256 136
Israel 4247 15
Norway 4102 22
Australia 4093 16
Sweden 3700 110
Czech Republic 2829 16
Ireland 2615 46
Malaysia 2470 34
Denmark 2395 72
Chile 2139 7
Luxembourg 1950 21
Ecuador 1890 58
Japan 1866 54
Poland 1862 22
Romania 1760 40
Russia 1534 8
Pakistan 1526 13
Philippines 1418 71
Thailand 1388 7
Indonesia 1285 114
South Africa 1280 2
Saudi Arabia 1229 8
Finland 1218 11
Greece 1156 38
India 1071 29
Iceland 1020 2
Mexico 993 20
Panama 989 24
Dominican Republic 859 39
Peru 852 18
Singapore 844 3
Argentina 820 20
Serbia 741 13
Slovenia 730 11
Croatia 713 6
Colombia 702 10
Estonia 679 3
Qatar 634 1
Egypt 576 36
New Zealand 552 1
Iraq 547 42

Base de dados da John Hopkins University

O JHU tem um site de monitoramento em tempo real (talvez o mais atualizado) no endereço https://coronavirus.jhu.edu/map.html. Os dados utilizados para o mapa estão em um GitHub https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19. Tem dados com atualização diária (parece que no mapa as atualizações são mais constantes; no final do dia são atualizados no GitHub).

Este é o link onde aparece o mapa também: https://data.humdata.org/dataset/novel-coronavirus-2019-ncov-cases

Fazendo o download dos arquivos diários ao invés destes consolidados (não tem o Recovered na última atualização)

O JHU mantém pelo menos 2 formatos dos dados: diários e consolidados (time series). Eu tentei utilizar o formato time series inicialmente, mas mudei para o formato diário, de modo que eu mesmo faço a consolidação. Isso permitiu um pouco mais de controle sobre os dados baixados.

Os dados são mantidos neste repositório GitHub:

https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19/raw/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_daily_reports/

O nome dos arquivos é MM-DD-YYYY.csv, começando a partir de 22 de Janeiro de 2020.

Depois de feito o download de todos os arquivos, é preciso juntá-los em um único data.frame. O processo começa com a leitura de todos os csv, colocando-os todos em uma list.

Com a lista de todos os arquivos (data.frames) diários, a função bind_rows do dplyr faz a concatenação. Algumas correções de nomes de países são também realizadas, visando normalizar e acertar grafias.

Total de Casos pelos dados da John Hopkins University (JHU): 29-03-2020

Casos Confirmados Mortos Recuperados
714079 33792 143518

Últimos 10 dias para alguns países: 29-03-2020

França
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
France 2020-03-20 12632 450 12 Europe
France 2020-03-21 14308 562 12 Europe
France 2020-03-22 16214 676 2201 Europe
France 2020-03-23 20123 862 2207 Europe
France 2020-03-24 22622 1102 3288 Europe
France 2020-03-25 25600 1333 3907 Europe
France 2020-03-26 29551 1698 4955 Europe
France 2020-03-27 33402 1997 5707 Europe
France 2020-03-28 38105 2317 5724 Europe
France 2020-03-29 40708 2611 7226 Europe
Itália
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
Italy 2020-03-20 47021 4032 4440 Europe
Italy 2020-03-21 53578 4825 6072 Europe
Italy 2020-03-22 59138 5476 7024 Europe
Italy 2020-03-23 63927 6077 7432 Europe
Italy 2020-03-24 69176 6820 8326 Europe
Italy 2020-03-25 74386 7503 9362 Europe
Italy 2020-03-26 80589 8215 10361 Europe
Italy 2020-03-27 86498 9134 10950 Europe
Italy 2020-03-28 92472 10023 12384 Europe
Italy 2020-03-29 97689 10779 13030 Europe
Espanha
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
Spain 2020-03-20 20410 1043 1588 Europe
Spain 2020-03-21 25374 1375 2125 Europe
Spain 2020-03-22 28603 1756 2125 Europe
Spain 2020-03-23 35136 2311 3355 Europe
Spain 2020-03-24 39885 2808 3794 Europe
Spain 2020-03-25 49515 3647 5367 Europe
Spain 2020-03-26 57786 4365 7015 Europe
Spain 2020-03-27 65719 5138 9357 Europe
Spain 2020-03-28 73235 5982 12285 Europe
Spain 2020-03-29 80110 6803 14709 Europe
Brasil
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
Brazil 2020-03-20 793 11 2 America
Brazil 2020-03-21 1021 15 2 America
Brazil 2020-03-22 1546 25 2 America
Brazil 2020-03-23 1924 34 2 America
Brazil 2020-03-24 2247 46 2 America
Brazil 2020-03-25 2554 59 2 America
Brazil 2020-03-26 2985 77 6 America
Brazil 2020-03-27 3417 92 6 America
Brazil 2020-03-28 3904 111 6 America
Brazil 2020-03-29 4256 136 6 America

Para poder estudar o crescimento do número de casos e de mortes, foi adicionada uma coluna com o número de casos de um dia para o outro, já que a base de dados reporta o total de casos em cada dia e não quantos casos foram registrados naquele dia.

Lista de países ordenados por número de casos confirmados: 29-03-2020

País Casos Mortes Recuperados
USA 140886 2467 2665
Italy 97689 10779 13030
China 82122 3304 75582
Spain 80110 6803 14709
Germany 62095 533 9211
France 40708 2611 7226
Iran 38309 2640 12391
United Kingdom 19780 1231 151
Switzerland 14829 300 1595
Netherlands 10930 772 253
Belgium 10836 431 1359
Turkey 9217 131 105
Austria 8788 86 479
South Korea 7478 53 118
Canada 6280 64 466
Portugal 5962 119 43
Norway 4284 25 7
Brazil 4256 136 6
Israel 4247 15 132
Australia 3984 16 244
Sweden 3700 110 16
Ireland 2615 46 5
Denmark 2564 72 73
Malaysia 2470 35 388
Chile 2139 7 75
Luxembourg 1950 21 40
Ecuador 1924 58 3
Japan 1866 54 424
Poland 1862 22 7
Romania 1815 43 206
Pakistan 1597 14 29
Russia 1534 8 64
Philippines 1418 71 42
Thailand 1388 7 97
Saudi Arabia 1299 8 66
Indonesia 1285 114 64
South Africa 1280 2 31
Finland 1240 11 10
Greece 1156 38 52
India 1024 27 95
Iceland 1020 2 135
Panama 901 17 4
Dominican Republic 859 39 3
Peru 852 18 16
Mexico 848 16 4
Singapore 844 3 212
Argentina 745 19 72
Serbia 741 13 0
Slovenia 730 11 10
Croatia 713 6 52
Colombia 702 10 10
Estonia 679 3 20
Qatar 634 1 48
Egypt 609 40 132
United Arab Emirates 570 3 58
Iraq 547 42 143
New Zealand 514 1 56
Algeria 511 31 31
Bahrain 499 4 272
Morocco 479 26 13
Ukraine 475 10 6
Lithuania 460 7 1
Lebanon 438 10 30
Armenia 424 3 30
Hungary 408 13 34
Latvia 347 0 1
Bulgaria 346 8 14
Andorra 334 6 1
Bosnia-Herzegovina 323 6 8
Costa Rica 314 2 3
Slovakia 314 0 2
Tunisia 312 8 2
Uruguay 304 1 0
Kazakhstan 284 1 20
Moldova 263 2 2
Jordan 259 3 18
North Macedonia 259 6 3
Kuwait 255 0 67
San Marino 224 22 6
Burkina Faso 222 12 23
Cyprus 214 5 15
Albania 212 10 33
Azerbaijan 209 4 15
Vietnam 188 0 25
Oman 167 0 23
Ivory Coast 165 1 4
Ghana 152 5 2
Malta 151 0 2
Uzbekistan 144 2 7
Senegal 142 0 27
Cameroon 139 6 5
Cuba 139 3 4
Brunei 126 1 34
Afghanistan 120 4 2
Venezuela 119 2 39
Sri Lanka 117 1 11
Nigeria 111 1 3
Honduras 110 3 3
Mauritius 107 3 0
Cambodia 103 0 21
Belarus 94 0 32
Kosovo 94 1 1
Georgia 91 0 18
Montenegro 85 1 0
Kyrgyzstan 84 0 0
Bolivia 81 1 0
Trinidad and Tobago 78 3 1
Rwanda 70 0 0
Paraguay 59 3 1
Liechtenstein 56 0 0
Bangladesh 48 5 15
Monaco 46 1 1
Taiwan 45 1 15
Kenya 42 1 1
Czech Republic 41 0 0
Madagascar 39 0 0
Guatemala 34 1 10
Barbados 33 0 0
Uganda 33 0 0
Jamaica 32 1 2
Zambia 29 0 0
Togo 25 1 1
El Salvador 24 0 0
Palestine 22 0 0
Ethiopia 21 0 1
Djibouti 18 0 0
Mali 18 1 0
Niger 18 1 0
Maldives 17 0 13
Guinea 16 0 0
Haiti 15 0 1
Tanzania 14 0 1
Equatorial Guinea 12 0 0
Eritrea 12 0 0
Mongolia 12 0 0
Bahamas 11 0 1
Dominica 11 0 0
Namibia 11 0 2
Grenada 9 0 0
Saint Lucia 9 0 1
Syria 9 1 0
Guyana 8 1 0
Laos 8 0 0
Libya 8 0 0
Mozambique 8 0 0
Seychelles 8 0 0
Suriname 8 0 0
Angola 7 2 0
Antigua and Barbuda 7 0 0
Gabon 7 1 0
Zimbabwe 7 1 0
Benin 6 0 0
Cape Verde 6 1 0
Holy See 6 0 0
Sudan 6 1 0
Fiji 5 0 0
Mauritania 5 0 2
Nepal 5 0 1
Bhutan 4 0 0
Gambia 4 1 0
Nicaragua 4 1 0
Central African Republic 3 0 0
Chad 3 0 0
Liberia 3 0 0
Somalia 3 0 0
Belize 2 0 0
Guinea-Bissau 2 0 0
Saint Kitts and Nevis 2 0 0
East Timor 1 0 0
Papua New Guinea 1 0 0
Saint Vincent and the Grenadines 1 0 1
Republic of the Congo 0 0 0

Alguns gráficos exploratórios com a base do JHU

Evolução dos casos após o 30º caso confirmado
DateRep Japan USA Italy France Germany Spain Brazil Argentina Chile
2020-02-06 45
2020-02-15 43
2020-02-16 59
2020-02-17 66
2020-02-18 74
2020-02-19 84
2020-02-20 94
2020-02-21 105 35
2020-02-22 122 35 62
2020-02-23 147 35 155
2020-02-24 159 53 229
2020-02-25 170 53 322
2020-02-26 189 59 453
2020-02-27 214 60 655 38 46
2020-02-28 228 62 888 57 48 32
2020-02-29 241 70 1128 100 79 45
2020-03-01 256 76 1694 130 130 84
2020-03-02 274 101 2036 191 159 120
2020-03-03 293 122 2502 204 196 165
2020-03-04 331 153 3089 285 262 222
2020-03-05 360 221 3858 377 482 259
2020-03-06 420 278 4636 653 670 400
2020-03-07 461 417 5883 949 799 500
2020-03-08 502 537 7375 1126 1040 673
2020-03-09 511 605 9172 1209 1176 1073
2020-03-10 581 959 10149 1784 1457 1695 31
2020-03-11 639 1281 12462 2284 1908 2277 38
2020-03-12 639 1663 12462 2284 2078 2277 52
2020-03-13 701 2179 17660 3667 3675 5232 151 31 43
2020-03-14 773 2726 21157 4480 4585 6391 151 34 61
2020-03-15 839 3499 24747 4513 5795 7798 162 45 74
2020-03-16 825 4632 27980 6650 7272 9942 200 56 155
2020-03-17 878 6421 31506 7683 9257 11748 321 68 201
2020-03-18 889 7786 35713 9052 12327 13910 372 79 238
2020-03-19 924 13680 41035 10886 15320 17963 621 97 238
2020-03-20 963 19101 47021 12632 19848 20410 793 128 434
2020-03-21 1007 25493 53578 14308 22213 25374 1021 158 537
2020-03-22 1086 33746 59138 16214 24873 28603 1546 266 632
2020-03-23 1128 43667 63927 20123 29056 35136 1924 266 746
2020-03-24 1193 53740 69176 22622 32986 39885 2247 387 922
2020-03-25 1307 65778 74386 25600 37323 49515 2554 387 1142
2020-03-26 1387 83836 80589 29551 43938 57786 2985 502 1306
2020-03-27 1468 101657 86498 33402 50871 65719 3417 589 1610
2020-03-28 1693 121478 92472 38105 57695 73235 3904 690 1909
2020-03-29 1866 140886 97689 40708 62095 80110 4256 745 2139

Calculando a taxa de progressão dia-a-dia: Brasil, Itália, USA, França, Alemanha, Espanha

DateRep Brazil France Germany Italy Japan China Spain USA
2020-03-01 1.00 1.30 1.65 1.50 1.062 1.01 1.87 1.09
2020-03-02 1.00 1.47 1.22 1.20 1.070 1.00 1.43 1.33
2020-03-03 1.00 1.07 1.23 1.23 1.069 1.00 1.38 1.21
2020-03-04 2.00 1.40 1.34 1.23 1.130 1.00 1.35 1.25
2020-03-05 1.00 1.32 1.84 1.25 1.088 1.00 1.17 1.44
2020-03-06 3.25 1.73 1.39 1.20 1.167 1.00 1.54 1.26
2020-03-07 1.00 1.45 1.19 1.27 1.098 1.00 1.25 1.50
2020-03-08 1.54 1.19 1.30 1.25 1.089 1.00 1.35 1.29
2020-03-09 1.25 1.07 1.13 1.24 1.018 1.00 1.59 1.13
2020-03-10 1.24 1.48 1.24 1.11 1.137 1.00 1.58 1.59
2020-03-11 1.23 1.28 1.31 1.23 1.100 c(“1.00”, “1.00”) 1.34 1.34
2020-03-12 1.37 1.00 1.09 1.00 1.000 c(“1.00”, “1.00”) 1.00 1.30
2020-03-13 2.90 1.61 1.77 1.42 1.097 1.00 2.30 1.31
2020-03-14 1.00 1.22 1.25 1.20 1.103 1.00 1.22 1.25
2020-03-15 1.07 1.01 1.26 1.17 1.085 1.00 1.22 1.28
2020-03-16 1.23 1.47 1.25 1.13 0.983 1.00 1.27 1.32
2020-03-17 1.60 1.16 1.27 1.13 1.064 1.00 1.18 1.39
2020-03-18 1.16 1.18 1.33 1.13 1.013 1.00 1.18 1.21
2020-03-19 1.67 1.20 1.24 1.15 1.039 1.00 1.29 1.76
2020-03-20 1.28 1.16 1.30 1.15 1.042 1.00 1.14 1.40
2020-03-21 1.29 1.13 1.12 1.14 1.046 1.00 1.24 1.33
2020-03-22 1.51 1.13 1.12 1.10 1.078 1.00 1.13 1.32
2020-03-23 1.24 1.24 1.17 1.08 1.039 1.00 1.23 1.29
2020-03-24 1.17 1.12 1.14 1.08 1.058 1.00 1.14 1.23
2020-03-25 1.14 1.13 1.13 1.08 1.096 1.00 1.24 1.22
2020-03-26 1.17 1.15 1.18 1.08 1.061 1.00 1.17 1.27
2020-03-27 1.14 1.13 1.16 1.07 1.058 1.00 1.14 1.21
2020-03-28 1.14 1.14 1.13 1.07 1.153 1.00 1.11 1.19
2020-03-29 1.09 1.07 1.08 1.06 1.102 1.00 1.09 1.16

Países com números de casos semelhantes ao Brasil: 29-03-2020

Olhando os dados de: - Portugal - Suécia (Sweden) - Turquia (Turkey) - Israel - Austrália (Australia)

Evolução dos casos após o 30º caso confirmado
DateRep Australia Sweden Israel Portugal Brazil Turkey
2020-03-02 30
2020-03-03 39
2020-03-04 52 35
2020-03-05 55 94
2020-03-06 60 101
2020-03-07 63 161
2020-03-08 76 203 39 30
2020-03-09 91 248 39 30
2020-03-10 107 355 58 41 31
2020-03-11 128 500 109 59 38
2020-03-12 128 599 131 59 52
2020-03-13 200 814 161 112 151
2020-03-14 250 961 193 169 151
2020-03-15 297 1022 251 245 162
2020-03-16 377 1103 255 331 200
2020-03-17 452 1190 337 448 321 47
2020-03-18 568 1279 433 448 372 98
2020-03-19 681 1439 677 785 621 192
2020-03-20 791 1639 705 1020 793 359
2020-03-21 1071 1763 883 1280 1021 670
2020-03-22 1490 1931 1071 1600 1546 1236
2020-03-23 1682 2046 1442 2060 1924 1529
2020-03-24 2044 2286 1930 2362 2247 1872
2020-03-25 2364 2526 2369 2995 2554 2433
2020-03-26 2810 2840 2693 3544 2985 3629
2020-03-27 3143 3069 3035 4268 3417 5698
2020-03-28 3640 3447 3619 5170 3904 7402
2020-03-29 3984 3700 4247 5962 4256 9217

Calculando a taxa de progressão dia-a-dia: Brazil, Portugal, Sweden, Turkey, Israel, Australia

DateRep Australia Brazil Israel Sweden Portugal Turkey
2020-03-01 1.08 1.00 1.43 1.17
2020-03-02 1.11 1.00 1.00 1.07 NA
2020-03-03 1.30 1.00 1.20 1.40 1.00
2020-03-04 1.33 2.00 1.25 1.67 2.50
2020-03-05 1.06 1.00 1.07 2.69 1.60
2020-03-06 1.09 3.25 1.31 1.07 1.62
2020-03-07 1.05 1.00 1.00 1.59 1.54
2020-03-08 1.21 1.54 1.86 1.26 1.50
2020-03-09 1.20 1.25 1.00 1.22 1.00
2020-03-10 1.18 1.24 1.49 1.43 1.37
2020-03-11 1.20 1.23 1.88 1.41 1.44 NA
2020-03-12 1.00 1.37 1.20 1.20 1.00 1.00
2020-03-13 1.56 2.90 1.23 1.36 1.90 5.00
2020-03-14 1.25 1.00 1.20 1.18 1.51 1.00
2020-03-15 1.19 1.07 1.30 1.06 1.45 1.20
2020-03-16 1.27 1.23 1.02 1.08 1.35 3.00
2020-03-17 1.20 1.60 1.32 1.08 1.35 2.61
2020-03-18 1.26 1.16 1.28 1.07 1.00 2.09
2020-03-19 1.20 1.67 1.56 1.13 1.75 1.96
2020-03-20 1.16 1.28 1.04 1.14 1.30 1.87
2020-03-21 1.35 1.29 1.25 1.08 1.25 1.87
2020-03-22 1.39 1.51 1.21 1.10 1.25 1.84
2020-03-23 1.13 1.24 1.35 1.06 1.29 1.24
2020-03-24 1.22 1.17 1.34 1.12 1.15 1.22
2020-03-25 1.16 1.14 1.23 1.10 1.27 1.30
2020-03-26 1.19 1.17 1.14 1.12 1.18 1.49
2020-03-27 1.12 1.14 1.13 1.08 1.20 1.57
2020-03-28 1.16 1.14 1.19 1.12 1.21 1.30
2020-03-29 1.09 1.09 1.17 1.07 1.15 1.25

Base de dados do Worldometer

Esta base de dados tem uma atualização bem interessante, com algumas variáveis também interessantes.

Ela está disponível em https://www.worldometers.info/coronavirus/

O problema é que não achei nenhum csv ou xlsx para baixar; então vou tentar fazer um web scraping e pegar os dados. Utilizando o pacote rvest e seguindo a dica deste post foi razoavelmente fácil.

Olhando a estrutura destes dados:

## 'data.frame':    202 obs. of  11 variables:
##  $ Country,Other   : chr  "USA" "Italy" "Spain" "Germany" ...
##  $ TotalCases      : chr  "145,131" "97,689" "85,195" "63,929" ...
##  $ NewCases        : chr  "+1,640" "" "+5,085" "+1,494" ...
##  $ TotalDeaths     : chr  "2,608" "10,779" "7,340" "560" ...
##  $ NewDeaths       : chr  "+26" "" "+537" "+19" ...
##  $ TotalRecovered  : chr  "4,574" "13,030" "16,780" "9,211" ...
##  $ ActiveCases     : chr  "137,949" "73,880" "61,075" "54,158" ...
##  $ Serious,Critical: chr  "2,972" "3,906" "5,231" "1,979" ...
##  $ Tot Cases/1M pop: chr  "438" "1,616" "1,822" "763" ...
##  $ Deaths/1M pop   : num  8 178 157 7 33 40 21 38 44 50 ...
##  $ Reported1st case: chr  "Jan 20" "Jan 29" "Jan 30" "Jan 26" ...

Depois de pegar a tabela em html e colocar em um data.frame, algumas limpezas e transformações são necessárias: algumas colunas, como a NewCases, tem o símbolo +; os números vieram formatados como strings com separador de milhar (,), e algumas outras coisas. Então, algumas manipulações serão feitas para acertar isso.

Country,Other TotalCases NewCases TotalDeaths NewDeaths TotalRecovered ActiveCases Serious,Critical Tot Cases/1M pop Deaths/1M pop Reported1st case
USA 145,131 +1,640 2,608 +26 4,574 137,949 2,972 438 8 Jan 20
Italy 97,689 10,779 13,030 73,880 3,906 1,616 178 Jan 29
Spain 85,195 +5,085 7,340 +537 16,780 61,075 5,231 1,822 157 Jan 30
Germany 63,929 +1,494 560 +19 9,211 54,158 1,979 763 7 Jan 26
Iran 41,495 +3,186 2,757 +117 13,911 24,827 3,511 494 33 Feb 18
France 40,174 2,606 7,202 30,366 4,632 615 40 Jan 23

Total de Casos pelos dados do Worldometer: 30-03-2020

TotalCasos TotalMortes TotalRecuperados
746062 35345 157078

Lista de países ordenados por número de casos confirmados: 30-03-2020

Country TotalCases TotalDeaths TotalRecovered
USA 145131 2608 4574
Italy 97689 10779 13030
Spain 85195 7340 16780
China 81470 3304 75700
Germany 63929 560 9211
Iran 41495 2757 13911
France 40174 2606 7202
UK 22141 1408 135
Switzerland 15526 333 1823
Belgium 11899 513 1527
Netherlands 11750 864 250
S. Korea 9661 158 5228
Austria 9454 108 636
Turkey 9217 131 105
Canada 6671 67 1014
Portugal 6408 140 43
Norway 4436 31 12
Brazil 4362 141 120
Israel 4347 16 134
Australia 4245 18 244
Sweden 4028 146 16
Czechia 2896 17 11
Malaysia 2626 37 479
Ireland 2615 46 5
Denmark 2577 77 1
Chile 2449 8 156
Luxembourg 1988 22 40
Poland 1984 26 7
Romania 1952 46 206
Ecuador 1924 58 3
Japan 1866 54 424
Russia 1836 9 66
Pakistan 1650 20 29
Philippines 1546 78 42
Thailand 1524 9 229
Saudi Arabia 1453 8 115
Indonesia 1414 122 75
Finland 1352 13 10
South Africa 1280 2 31
Greece 1212 43 52
Iceland 1086 2 157
India 1071 29 100
Mexico 993 20 35
Panama 989 24 4
Dominican Republic 901 42 4
Singapore 879 3 228
Peru 852 18 16
Argentina 820 22 228
Croatia 790 6 67
Serbia 785 16 42
Slovenia 756 11 10
Estonia 715 3 20
Diamond Princess 712 10 603
Colombia 702 10 10
Hong Kong 642 4 118
Qatar 634 1 48
UAE 611 5 61
Egypt 609 40 132
New Zealand 589 1 63
Iraq 547 42 143
Morocco 516 29 14
Bahrain 515 4 279
Algeria 511 31 31
Lithuania 484 7 1
Armenia 482 3 30
Ukraine 480 11 6
Hungary 447 15 34
Lebanon 446 11 35
Latvia 376 1
Bulgaria 359 8 17
Bosnia and Herzegovina 354 8 17
Slovakia 336 7
Andorra 334 6 6
Costa Rica 314 2 3
Tunisia 312 8 2
Uruguay 310 1
Taiwan 306 5 39
Kazakhstan 302 1 21
Moldova 298 2 15
North Macedonia 285 7 12
Azerbaijan 273 4 26
Kuwait 266 72
Jordan 259 4 18
San Marino 230 25 13
Cyprus 230 7 15
Albania 223 11 44
Burkina Faso 222 12 23
Vietnam 203 55
Réunion 183 1
Oman 179 29
Cuba 170 4 4
Faeroe Islands 168 70
Ivory Coast 165 1 4
Senegal 162 27
Malta 156 2
Ghana 152 5 2
Belarus 152 32
Uzbekistan 149 2 7
Afghanistan 145 4 2
Channel Islands 141 2
Cameroon 139 6 5
Honduras 139 3 3
Venezuela 129 3 39
Mauritius 128 3
Brunei 127 1 38
Sri Lanka 122 2 15
Palestine 115 1 18
Nigeria 111 1 3
Cambodia 107 21
Guadeloupe 106 4 17
Georgia 100 18
Bolivia 97 4
Kyrgyzstan 94 3
Martinique 93 1
Montenegro 91 1
Trinidad and Tobago 82 3 1
Mayotte 82 10
DRC 81 8 2
Rwanda 70
Gibraltar 65 14
Paraguay 64 3 1
Liechtenstein 62
Kenya 50 1 1
Aruba 50 1
Bangladesh 49 5 19
Isle of Man 49
Monaco 46 1 1
French Guiana 43 6
Madagascar 39
Macao 38 10
Guatemala 36 1 10
Jamaica 36 1 2
French Polynesia 35
Zambia 35
Barbados 33
Uganda 33
Togo 30 1 1
El Salvador 30
Mali 25 2
Ethiopia 23 4
Niger 22 3
Bermuda 22 2
Guinea 22
Congo 19
Tanzania 19 1
Djibouti 18
Maldives 17 13
Saint Martin 15 1 2
Haiti 15 1
New Caledonia 15
Bahamas 14 1
Myanmar 14
Cayman Islands 12 1
Equatorial Guinea 12
Eritrea 12
Mongolia 12 2
Curaçao 11 1 2
Dominica 11
Namibia 11 2
Greenland 10 2
Syria 9 1
Grenada 9
Saint Lucia 9 1
Eswatini 9
Guyana 8 1
Guinea-Bissau 8
Laos 8
Libya 8
Mozambique 8
Seychelles 8
Suriname 8
Angola 7 2
Gabon 7 1
Zimbabwe 7 1
Antigua and Barbuda 7
Saint Kitts and Nevis 7
Sudan 6 2
Cabo Verde 6 1
Benin 6
Vatican City 6
St. Barth 6 1
Sint Maarten 6
Nepal 5 1
Chad 5
Fiji 5
Mauritania 5 2
Montserrat 5
Turks and Caicos 5
Gambia 4 1
Nicaragua 4 1
Bhutan 4
CAR 3
Liberia 3
Somalia 3
MS Zaandam 2
Anguilla 2
Belize 2
British Virgin Islands 2
Papua New Guinea 1
St. Vincent Grenadines 1 1
Timor-Leste 1

HOME HOME